Полномочия администрации муниципального образования «Усть-Коксинский район» определены Федеральным законом от 06.10.2003 №131-ФЗ «Об общих принципах организации местного самоуправления в Российской Федерации».
Также полномочия администрации муниципального образования «Усть-Коксинский район» закреплены статьей 32 Устава муниципального образования «Усть-Коксинский район».
1. Администрация осуществляет полномочия по решению вопросов местного значения, установленные федеральными законами, настоящим Уставом.
Администрация на территории сельских поселений, входящих в состав муниципального образования, осуществляет полномочия по решению вопросов местного значения, которые решаются органами местного самоуправления муниципального образования в соответствии с частью 4 статьи 14 Федерального закона «Об общих принципах организации местного самоуправления в Российской Федерации».
2. Помимо установленных настоящей статьей полномочий Администрация осуществляет иные полномочия, предусмотренные для местной администрации (исполнительно-распорядительного органа муниципального образования) законодательством Российской Федерации, Республики Алтай, настоящим Уставом, а равно полномочия, не отнесенные законодательством, настоящим Уставом к полномочиям других органов местного самоуправления.
Муниципальное образование принимает федеральные законы, федеральные конституционные законы и законы о поправках к Конституции, которые вступают в силу после одобрения Советом Федерации, подписания Президентом и опубликования. Федеральные законы принимаются простым большинством голосов. Двумя третями (300 голосов) Муниципальное образование преодолевает вето Совета Федерации или Президента; одобряет федеральные конституционные законы и законы о поправках к Конституции.